MICROBIOTA: O QUE PRECISAMOS SABER NA PRÁTICA CLÍNICA

  

Você sabe o que é microbiota intestinal? Qual sua relação com uma dieta vegetariana? Aqui neste artigo, você aprenderá algumas coisas sobre esse exército tão importante para o nosso corpo. Nos acompanhe!
MICROBIOTA: O QUE PRECISAMOS SABER NA PRÁTICA CLÍNICA


Ortigão R. 
· Pimentel-Nunes P. a, b · Dinis-Ribeiro M. a, b · Libânio D. a, b

Afiliações do autor

Autor correspondente

GE Port J Gastroenterol 2020; 27: 336–351

GE - Revista Portuguesa de Gastroenterologia

Artigo de revisão


Resumo

A microbiota intestinal humana desempenha um papel importante na saúde individual. Quando o equilíbrio entre a microbiota do hospedeiro e do intestino é interrompido, ocorrem mudanças na composição e função da microbiota, o que é conhecido como disbiose. Fatores ambientais como dieta, inibidores da bomba de prótons e antibióticos podem levar a uma interrupção disbiótica permanente. O esclarecimento desses desequilíbrios foi possível graças aos avanços recentes nos métodos de sequenciamento do genoma que apoiaram o reconhecimento da interação entre o microbioma e os distúrbios intestinais e extra-intestinais. Esta revisão enfoca o impacto da microbiota na doença inflamatória do intestino, câncer gástrico, câncer colorretal, doença hepática gordurosa não alcoólica (NAFLD), síndrome do intestino irritável (IBS) e Clostridium difficileinfecção (CDI). Além disso, novas terapias são resumidas. O transplante de microbiota fecal (FMT) é uma terapia bem-sucedida e estabelecida em CDI recorrente, e sua aplicação em outras doenças relacionadas à disbiose está atraindo enorme interesse. Os pré e probióticos têm como alvo o reequilíbrio microbiano e têm efeitos positivos principalmente em pacientes com DHGNA, colite ulcerativa, SII e CDI. Efeitos anticarcinogênicos promissores também foram demonstrados em modelos animais. A literatura descreve cada vez mais as alterações microbianas em muitos distúrbios disbióticos e mostra o que precisa ser tratado. No entanto, a aplicação de probióticos e FMT na prática clínica sofre de uma escassez de ensaios clínicos randomizados com regimes de terapia padronizados para apoiar sua recomendação.

© 2020 Sociedade Portuguesa de Gastrenterologia Publicado por S. Karger AG, Basel


Microbioma gastrointestinal - o que precisamos de saber na prática clínica

Palavras Chave

Microbiota · Disbiose · Doenças associada a disbiose · Probióticos · Transplante de microbiota fecal ·

Resumo

Uma microbiota gastrointestinal desempenha um papel essencial na saúde humana. Quando surge um desequilíbrio entre esta e a hospedeiro, ocorrem mudanças na composição e função da microbiota que se designa de disbiose. Fatores ambientais como a dieta, inibidores da bomba de protões e antibióticos podem induzir um estado disbiótico permanente. O esclarecimento estas desregulações foi possível graças a avanços recentes nos métodos de sequenciação genómica que, por sua vez, nos ajudaram a perceber uma interação entre a microbiota e distúrbios intestinais e extra-intestinais. Esta revisão foca-se sem impacto da microbiota na Doença Inflamatória Intestinal, Cancros gástrico e colorretal, Fígado Gordo Não-Alcoólico (FGNA), Síndroma do Intestino Irritável (SII) e Infeção por Clostridium difficile(CID). Além disso, resume-se no final as drogas terapêuticas que têm surgido. O transplante fecal é um tratamento com sucesso obtido na infecção recorrente por C. difficile , reunindo um crescente interesse na sua aplicação em outras doenças relacionadas com disbiose. Os pré- e probióticos promovem o reequilíbrio microbiano e evidência de efeitos positivos sobretudo no FGNA, Colite Ulcerosa, SII e ICD .Em modelos animais, estes também demonstraram efeitos anti-cancerígenos promissores. É evidente na literatura uma descrição cada vez mais pormenorizada das mudanças microbianas em vários distúrbios disbióticos, oferecendo ferramentas que permitem saber ou que pode ser tratado. No entanto, uma aplicação de probióticos e transplante fecal na prática clínica sofre ainda de carência de ensaios randomizados, com regimes terapêuticos padrão, em número que permite a sua recomendação formal.


Introdução

O trato gastrointestinal é o nosso órgão mais colonizado, com cem trilhões de organismos simbioticamente relacionados aos humanos [ 1 ]. Microbiota humana refere-se a toda a população de microrganismos (bactérias, fungos, arquéias, vírus e protozoários) que vivem no corpo humano, com seus genomas coletivos formando o metagenoma humano [ 2 ].

Em um indivíduo saudável, a microbiota tem importantes funções metabólicas [ 3 ] e imunológicas [ 4 ]. No cólon, fornece as enzimas necessárias à fermentação dos carboidratos, gerando ácidos graxos de cadeia curta (SCFA) na forma de butirato. SCFA fornece cerca de 70% da energia para os colonócitos, preservando a barreira intestinal e aumentando as propriedades antiinflamatórias e anticâncer [ 5 ]. A interação hospedeiro-microbioma é essencial para a manutenção de um sistema imunológico forte, permitindo que o trato gastrointestinal permaneça saudável e livre de bactérias patogênicas [ 6 ].

A composição microbiana intestinal varia muito entre os indivíduos e em diferentes segmentos gastrointestinais. No entanto, entre adultos saudáveis, é consistentemente dominado por bactérias de dois filos, Bacteroidetes e Firmicutes, enquanto Actinobacteria e Proteobacteria são encontradas com menos frequência [ 7 ]. Notavelmente, a diversidade e a densidade das espécies bacterianas aumentam do intestino proximal para o distal.

Um aspecto desafiador do estudo da microbiota é a dificuldade em definir um estado de eubiose ideal, devido a essa grande variabilidade entre indivíduos saudáveis. No entanto, na maioria dos estudos, certas bactérias comensais, como Roseburia , Akkermansia , Bifidobacterium e Faecalibacterium prausnitzii parecem estar associadas a um intestino saudável. Independentemente disso, às vezes o equilíbrio entre o hospedeiro e a microbiota intestinal é perdido e ocorrem mudanças em sua composição e função, o que costuma ser chamado de disbiose [ 8As colônias microbianas vivem em ambientes altamente competitivos, lutando pelos mesmos nichos e recursos. A disbiose geralmente apresenta uma ou mais das seguintes características: perda de comensais, crescimento excessivo de organismos potencialmente prejudiciais e redução da diversidade geral [ 9 ].

Mudanças na abundância e composição da microbiota têm sido relacionadas a vários distúrbios intestinais e extra-intestinais em humanos. No entanto, existe uma lacuna entre os achados científicos básicos e a prática clínica. Nesta revisão, descrevemos os fatores que afetam a microbiota e, em seguida, resumimos os desequilíbrios da microbiota associados a doenças gastrointestinais prevalentes e terapias potenciais, a saber, doença inflamatória intestinal (DII), câncer gástrico (GC), câncer colorretal (CRC), doença hepática gordurosa não alcoólica (NAFLD ), Infecção por Clostridium difficile (CDI) e síndrome do intestino irritável (IBS).

Métodos para Análise de Microbioma

Geralmente, os microrganismos gastrointestinais são difíceis de isolar em cultura, tornando difícil entender a verdadeira complexidade microbiana. Essa limitação foi parcialmente superada nas últimas décadas com o uso de sequenciamento de DNA para definir o conteúdo genético do microbioma.

A maioria das técnicas tem como alvo o gene do RNA ribossômico 16S (16SrRNA), pois ele é altamente conservado entre diferentes espécies de bactérias. Ao sequenciar esse gene, respondemos à pergunta “quem está aí”? revelando a abundância relativa de uma dada taxa bacteriana.

A análise do gene marcador difere do sequenciamento shotgun metagenômico (denominado sequenciamento shotgun do genoma completo - WGS), pois é baseado no direcionamento de um amplicon (uma sequência alvo ou gene que é amplificado) em vez de tentar sequenciar todos os genes em uma amostra [ 10 ].

16A técnica de sequenciamento de RNAr dificilmente se aproxima dos níveis taxonômicos mais profundos e não infere uma relação entre uma espécie bacteriana e sua capacidade funcional. No entanto, esta técnica permanece mais barata, facilmente acessível e ainda reconhece a diversidade e composição microbiana [ 11 ].

O sequenciamento WGS seguido por análise metagenômica também identifica a quantidade e diversidade da comunidade microbiana, mas adiciona informações mais detalhadas para a caracterização taxonômica de uma amostra. Com essa abordagem, respondemos à pergunta “o que eles podem fazer”, identificando o conteúdo do gene e as funções potenciais inferidas do DNA microbiano [ 12 ]. O DNA genômico é isolado do ambiente em estudo, mas não distingue se vem de células viáveis ​​ou não, ou se os genes previstos são expressos e em que circunstâncias [ 13 ].

A introdução da análise metatranscriptômica ultrapassou as limitações de todos os outros métodos do microbioma intestinal. A metatranscriptômica revela o conteúdo total dos transcritos de genes (tRNA) na microbiota, respondendo à pergunta “o que eles estão fazendo”? 11 ]. Como a análise metatranscriptômica complementa a metagenômica, podemos saber quais dos genes que foram marcados na análise metagenômica são transcritos e em que medida, demonstrando alterações funcionais que contribuem para a saúde e doença antes mesmo que ocorra uma modificação composicional [ 14 ]. No entanto, a metatranscriptômica é ainda mais cara e complexa do que a metagenômica.

A combinação de todas as abordagens pode abrir uma janela para uma compreensão mais profunda dos genes e vias potenciais que podem contribuir para a homeostase e suscetibilidade a doenças, de modo que novos alvos farmacológicos possam ser explorados [ 15 ].

Fatores que afetam a microbiota

Muitos estudos têm sido conduzidos sobre fatores capazes de influenciar o microbioma gastrointestinal humano, incluindo a genética do hospedeiro e fatores ambientais [ 7 ]. Aqui, vamos nos concentrar no último, ou seja, dieta, inibidores da bomba de prótons (IBP) e antibióticos.

Dieta

Dentre os fatores ambientais, a dieta é talvez a mais facilmente modificável. Muitos estudos tentaram elucidar a ligação entre a dieta ocidental e a disbiose intestinal como um gatilho para o comprometimento da permeabilidade intestinal e da função de barreira [ 16 ]. A dieta ocidental consiste principalmente de proteínas animais, gorduras totais e saturadas e açúcares simples, em vez de frutas e vegetais, e foi associada à redução da colonização bacteriana e a um aumento do número de Bacteroides (principalmente bactérias degradadoras de mucina), Firmicutes e Proteobacteria phyla [ 17 ] Um estudo recente relatou que uma dieta pobre em fibras resultou no consumo da microbiota da camada de muco, o que leva a um epitélio mais fino, aumentando as chances de ataque patogênico invasivo [ 18 ].

A dieta mediterrânea é baseada no alto consumo de frutas, vegetais, cereais não refinados e peixes e baixo consumo de carne vermelha e foi associada a benefícios para a microbiota intestinal, diminuindo a carga de Escherichia coli e aumentando os níveis de SCFA [ 19 ].

A microbiota intestinal sofre mudanças relativamente rápidas após a exposição a diferentes dietas. David et al. 20 ] mostraram que dietas ricas em gordura consistindo exclusivamente de alimentos de origem animal mudaram o microbioma em apenas 2 dias, tanto na estrutura quanto na função. No entanto, a magnitude desse efeito parece modesta, já que a mudança na dieta não necessariamente resulta em modificação permanente da composição, pelo menos no nível do filo, uma vez que as mudanças diárias ocorrem principalmente no nível de gênero e espécie. No mesmo estudo, a análise de sequenciamento de RNA revelou aumento da expressão de genes relacionados ao catabolismo de aminoácidos e à produção de hidrocarbonetos aromáticos policíclicos carcinogênicos na dieta animal, em comparação com a dieta vegetal.

Sabendo que a dieta pode promover disbiose intestinal e consequentemente doenças associadas, fica claro que a modificação da dieta deve ser considerada como terapia adjuvante.

Inibidores da bomba de protões

O pH gástrico luminal é normalmente 1,5–3,5, e o PPI aumenta o pH para valores acima de 3,5–5,0, o que pode afetar a composição da microbiota devido ao aumento do pH e também por alvejar diretamente a bomba de prótons dos microrganismos.

O uso de IBP pode levar ao desenvolvimento de infecções entéricas, como CDI [ 21 ]. Tsuda et al. 22 ] analisaram 18 indivíduos tomando IBP por mais de 2 anos e 27 voluntários saudáveis ​​que nunca haviam tomado um IBP e encontraram uma correlação significativa entre o valor do pH e a contagem bacteriana em todas as amostras de fluido gástrico. Seus dados sugeriram que o supercrescimento bacteriano no estômago durante o uso de PPI pode surgir de uma falta de morte em vez da proliferação de bactérias devido à baixa acidez gástrica.

Um estudo recente realizado no Japão também examinou amostras fecais de pacientes em três pontos (antes e 4 e 8 semanas após o início do tratamento com IBP) [ 23 ]. As diferenças nas contagens bacterianas totais nestes 3 pontos não foram significativas, embora as contagens totais de anaeróbios facultativos, como Lactobacillus, Streptococcus, Staphylococcus e Enterobacteriaceae tenham aumentado significativamente após o tratamento [ 23 ]. Os estreptococos são comensais da cavidade oral humana, garganta e cavidade nasal e são inativados pela acidez gástrica, que cria uma barreira contra a invasão bacteriana do trato gastrointestinal inferior. O aumento do pH gástrico após o uso de PPI pode ser uma das razões pelas quais muitos estudos de caso-controle detectamStreptococcus em amostras fecais, sugerindo que a translocação bacteriana ocorreu [ 22 , 24 ].

Os IBP são amplamente prescritos tanto em ambulatório quanto em regime de internação, em muitos casos sem indicação formal. Os efeitos colaterais do IBP não são desprezíveis e, portanto, a tomada de decisão sobre seu uso deve ser mais cuidadosa.

Antibióticos

Os antibióticos são armas poderosas contra bactérias patogênicas, mas também podem afetar organismos comensais, resultando em perda de diversidade microbiana, mudanças na capacidade metabólica e resistência à colonização reduzida contra patógenos invasivos [ 25 ].

Poucos dias após o tratamento com antibióticos, foram descritas mudanças rápidas e profundas na microbiota intestinal. Um estudo de caso-controle descobriu que antibióticos orais de amplo espectro (ciprofloxacina, vancomicina e metronidazol) por 7 dias foram associados a uma perda de diversidade e mudanças drásticas na composição da comunidade no dia 9 [ 26 ]. Apesar dos grandes efeitos de curto prazo, houve um retorno notável à linha de base após 8–31 meses de tratamento. No entanto, evidências crescentes sugerem que o microbioma pode ser pelo menos ligeiramente perturbado por longos períodos de tempo, algumas cepas são perdidas indefinidamente [ 27 ] e as consequências como a resistência aos antibióticos podem persistir por períodos mais longos [ 28 ].

Uma relação entre o uso de antibióticos no início da vida e o desenvolvimento de doenças na infância, como obesidade e doença de Crohn (DC), também foi sugerida [ 29 , 30 ]. O número de tratamentos com antibióticos e quanto mais cedo as crianças os tomam parecem ser fatores contribuintes importantes.

Outra preocupação com a antibioticoterapia é a colonização e infecção por C. difficile , uma vez que o uso de antibióticos é sua principal causa. Uma meta-análise de 2016 mostrou que a clindamicina foi o antibiótico mais frequentemente associado a CDI em pacientes hospitalizados, seguido por carbapenêmicos [ 31 ]. Posteriormente, nos concentraremos nos efeitos do próprio CDI no ambiente da microbiota intestinal.

Papel potencial da disbiose em doenças gastrointestinais

Várias doenças altamente prevalentes foram associadas a desequilíbrios na composição e função da microbiota, incluindo IBD, obesidade, diabetes, alergia, IBS, GC, pólipos colorretais e CRC, cirrose hepática, NAFLD, distúrbios do neurodesenvolvimento, distúrbios cardiovasculares, cálculos biliares de colesterol, diarreia, desnutrição e doença renal [ 32 ]. No entanto, ainda não foi estudado se essa mudança na composição microbiana é causa ou consequência da própria doença. Daremos agora ênfase às associações microbioma-doença gastrointestinal recentemente descritas na literatura.

Câncer colorretal

O CCR é o terceiro câncer mais comum e o quarto mais mortal do mundo [ 33 ]. Embora também existam componentes genéticos no desenvolvimento de adenomas colorretais e câncer, é uma doença multifatorial, pois envolve vários elementos, como imunidade do hospedeiro, fatores ambientais e microbiota intestinal [ 34 ].

A contagem de bactérias do cólon é um milhão de vezes maior do que no intestino delgado, e há 12 vezes mais cânceres lá, o que pode ser em parte devido a um papel da microbiota colônica na carcinogênese [ 35 ]. Anteriormente, o CRC estava associado a bactérias específicas, como Streptococcus gallolyticus (antigo S. bovis ) [ 36 ], E. coli [ 37 ], Bacteroides fragilis [ 38 ], Clostridium septicum [ 39 ] e outras. Mais recentemente, os casos de câncer foram relacionados não apenas a uma bactéria específica, mas também à disbiose, com uma diminuição na diversidade e na estabilidade da comunidade da microbiota intestinal [ 40]

As alterações da microbiota em pacientes com CRC são ilustradas na Tabela 1 . Em vários estudos, um aumento da prevalência de Fusobacterium foi mostrado em pacientes com CRC [ 41 - 43 ] e no tecido adenomatoso em comparação com o tecido circundante [ 44 ], sugerindo um possível papel na cascata adenoma-câncer. De acordo com Bullman et al. 45 ], o tratamento com metronidazol diminui bastante a carga de Fusobacterium no tecido tumoral e reduz o crescimento do tumor de cólon em modelos de camundongo. Portanto, Fusobacterium pode ser um marcador de fezes para risco aumentado de CRC.

Tabela 1.

Alterações da microbiota no câncer gastrointestinal

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O sequenciamento do RNA bacteriano também revelou níveis reduzidos de Firmicutes em pacientes com CRC em amostras de fezes e de biópsia de tumor, em comparação com indivíduos saudáveis ​​[ 41 ]. Por outro lado, os dados relativos a Bacteroidetes são inconsistentes [ 41 , 46 ].

Em um estudo recente, Rezasoltani et al. 47 ] encontraram uma relação significativa entre o tamanho do pólipo e a quantidade de Fusobacterium nucleatum , Streptococcus bovis , Lactobacillus spp., Roseburia spp. E Porphyromonas spp. Este estudo de caso-controle elucidou o papel que algumas bactérias específicas poderiam ter no desenvolvimento do adenoma.

Estudos em modelos de camundongos também sugerem que a disbiose pode ser um gatilho para o CRC induzido por inflamação. Um mecanismo sugerido envolve a falta de SCFAs, pois as bactérias responsáveis ​​por sua produção, como Faecalibacterium e Roseburia , são reduzidas na microbiota fecal durante o desenvolvimento do CRC [ 48 ]. O butirato é conhecido por ser anticarcinogênico, pois inibe a proliferação celular, induz apoptose de células tumorais e medeia células T [ 49 ].

Câncer de intestino

GC é o quinto tumor maligno mais comum e a terceira principal causa de morte relacionada ao câncer [ 33 ]. Cerca de 81% da incidência de GC é atribuível ao Helicobacter pylori , tornando esse microrganismo o patógeno mais comum ligado a essa malignidade [ 50 ].

A erradicação efetiva do H. pylori não previne inteiramente a carcinogênese gástrica [ 51 , 52 ] e apenas 1–2% dos indivíduos positivos para H. pylori desenvolvem GC [ 53 ]. Além disso, em camundongos transgênicos insulina-gastrina, a colonização simultânea por H. pylori e uma microbiota gástrica complexa aumentaram a incidência de CG [ 54 ], acelerando o aparecimento de malignidade, quando comparados àqueles infectados apenas por H. pylori [ 55 ]. Essas linhas de evidência sugerem que outros comensais na microbiota gástrica podem contribuir para o desenvolvimento do câncer.

A infecção por H. pylori diminui a acidez gástrica, permitindo o estabelecimento de uma nova microbiota que poderia potencializar a carcinogênese. Essas bactérias crescem excessivamente em um ambiente hipoácido e são capazes de converter compostos de nitrogênio em compostos N-nitroso potencialmente carcinogênicos [ 56 ]. Numerosas bactérias, tais como E. coli , Haemophilus , Neisseria , Staphylococcus , Lactobacillus , nitrospira , e Veilonella podem produzir estes compostos [ 57 , 58 ], e alguns autores já demonstrou um aumento em algumas destas bactérias em GC [ 59 - 62]

O ambiente microbiano do GC é ilustrado na Tabela 1 . Os dados relativos à diversidade bacteriana em GC são inconsistentes. Aviles-Jimenez et al. 61 ] relataram uma diminuição da diversidade microbiana de gastrite não atrófica a metaplasia intestinal e GC. Na verdade, a maioria dos estudos relatou uma diminuição da diversidade microbiana [ 61 , 62 ], embora alguns autores tenham descrito o contrário [ 59 , 63 ].

Curiosamente, vários estudos observaram o mesmo padrão crescente ao estudar espécies de Lactobacillus em GC [ 61 - 63 ]. Essas espécies são utilizadas em probióticos, sendo benéficas para o hospedeiro. No entanto, no estômago os Lactobacillus aumentam o ácido láctico que pode servir como energia para as células tumorais e também promover inflamação e angiogênese tumoral [ 64 ].

Os comensais bacterianos orais também podem ter um papel importante na patogênese e progressão da malignidade gástrica, visto que muitos estudos mostram níveis crescentes desses microrganismos em amostras de GC [ 60 , 65 ].

Doença inflamatória intestinal

A DII é uma doença inflamatória crônica, recorrente e remitente do trato gastrointestinal, que consiste em duas formas principais, CD e colite ulcerativa (UC). Apesar de muitos esforços, nenhuma etiologia exata foi descrita, mas acredita-se que envolva uma interação entre fatores genéticos e ambientais que podem desregular a resposta imune do hospedeiro à microbiota intestinal.

Atualmente, é aceito que a disbiose intestinal é um mecanismo potencialmente relevante subjacente à patogênese da DII [ 66 ]. É importante ressaltar que regiões com altas cargas de bactérias estão correlacionadas com maior incidência de DC e UC, particularmente íleo terminal e cólon.

As alterações da microbiota relacionadas aos pacientes com DII estão resumidas na Tabela 2 . Os achados característicos em IBD incluem diversidade e estabilidade bacteriana reduzida, principalmente devido a membros esgotados de Firmicutes e filos Proteobacteria e Actinobacteria enriquecidos [ 67 , 68 ]. A disbiose pode ocorrer antes do início da inflamação intestinal em camundongos geneticamente suscetíveis, conforme comprovado por Glymenaki et al. 69 , 70 ] em dois estudos diferentes.

Mesa 2.

Alterações da microbiota em pacientes com síndrome do intestino inflamatório

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O esgotamento de certas bactérias com a conseqüente perda de suas funções protetoras tem uma influência importante sobre as doenças. Vários estudos recentes relataram menor proporção de F. prausnitzii em pacientes com DII [ 71 , 72 ]. Este comensal é um membro do filo Firmicutes e um grande produtor do SCFA, com importantes funções antiinflamatórias e de proteção celular [ 73 , 74 ]. Além disso, uma equipe de pesquisa da França [ 71 ] encontrou uma ligação entre a recidiva da DC e baixos níveis de F. prausnitzii , proteína C reativa alta e baixa taxa de Bacteroides .

O estado de disbiose UC tem sido associado ao aumento do filo Bacteroidetes [ 75 ] e gênero Bacteroides [ 76 ], mais especificamente com B. fragilis e vulgatus [ 75 ].

Com os avanços no sequenciamento de DNA, Morgan et al. 74 ] indicaram que a função microbiana foi consistentemente mais perturbada (12%) do que a composição (2%), levando à conclusão de que os estudos de composição da microbiota podem subestimar seu impacto na patogênese de IBD.

Doença hepática gordurosa não alcoólica

NAFLD abrange um espectro de doenças hepáticas de esteatose a esteatohepatite não-alcoólica, fibrose, cirrose e, eventualmente, carcinoma hepatocelular, no qual ocorre deposição de gordura no fígado. NAFLD requer a exclusão do consumo diário de álcool de mais de 30 g para homens e 20 g para mulheres. Nos últimos anos, a NAFLD emergiu como uma das causas mais comuns de doença hepática em todo o mundo [ 77 ].

A eficácia das mudanças no estilo de vida, como modificações na dieta e na atividade física, têm grande impacto no controle metabólico e na histologia hepática [ 78 ], deixando clara a importância dos fatores ambientais nesta doença. No entanto, existe uma grande variabilidade na progressão da NAFLD que não é explicada pela genética ou pelo ambiente.

O fígado é o primeiro órgão a ser exposto, através do trato portal, a metabólitos de origem intestinal, como nutrientes dietéticos e produtos relacionados à microbiota. Devido a essa interação direta entre o intestino e o fígado, a microbiota disbiose foi apontada como um fator importante na patologia de todos os estágios da NAFLD [ 79 ]. A disbiose pode levar ao aumento da permeabilidade intestinal, promovendo a translocação de metabólitos comensais através do sistema vascular para o fígado (endotoxemia), o que contribui diretamente para a interrupção do metabolismo lipídico hepático e processos inflamatórios no fígado [ 80 ].

Numerosos investigadores têm estudado a composição da microbiota em pacientes com DHGNA. Em um estudo comparando o microbioma intestinal entre pacientes não obesos com DHGNA e controles saudáveis, o primeiro grupo tinha mais Bacteroidetes e menos Firmicutes [ 81 ]. Dentro de Firmicutes, as bactérias produtoras de SCFA e as bactérias 7α-desidroxiladoras diminuíram [ 81 ].

Alguns autores têm tentado correlacionar uma bactéria específica com fibrose hepática na DHGNA. Duarte et al. 82 ] encontraram uma associação com aumento de Lactobacillus , e Boursier et al. 79 ] descreveram uma correlação com Ruminococcus . Um estudo recente [ 83 ] descreveu a microbiota intestinal da NAFLD como dominada por Firmicutes e Bacteroidetes, seguida por Proteobacteria e Actinobacteria em proporções mais baixas. No entanto, com a progressão da fibrose, há um aumento significativo na abundância do filo Proteobacteria, enquanto a de Firmicutes diminui. A disbiose começa no início da doença hepática e depende muito dos fatores etiológicos [ 84 ].

É claro que a microbiota varia durante o curso da NAFLD, e isso poderia explicar as diferenças encontradas na composição da microbiota. No entanto, esses estudos diferem nas definições usadas, desenho do estudo e desfechos clínicos, tornando inadequado tirar conclusões gerais.

Infecção por C. difficile

C. difficile é um patógeno bacteriano anaeróbico, Gram-positivo, esporulante, e é reconhecido como a principal causa de diarreia nosocomial associada a antibióticos [ 85 ]. Em circunstâncias normais, os comensais intestinais previnem a colonização por C. difficile , suprimindo sua atividade patogênica no cólon, pela germinação de esporos e produção de toxinas.

A microbiota intestinal humana sofre enormes mudanças ao longo da vida; consequentemente, não é surpreendente que o CDI seja mais comum em pessoas idosas [ 86 ]. Assim como a idade, muitos fatores de risco contribuem para o rompimento da microbiota intestinal e suscetibilidade à ICD, mas a terapia antimicrobiana é a que tem maior impacto [ 87 ].

Geralmente, em pacientes com CDI, é observada redução da diversidade bacteriana geral [ 88 ]. Proteobactérias aumentadas e redução dos filos Firmicutes e Bacteroidetes são os achados mais frequentes nesses pacientes [ 89 , 90 ].

Atualmente, o tratamento padrão para um episódio inicial de CDI não grave é a vancomicina ou fidaxomicina oral [ 91 ]. Cerca de um quarto de todos os pacientes com CDI terá uma recorrência, com taxas crescentes em cada episódio subsequente [ 92 ]. Uma investigação de Seekatz et al. 93] elucidaram que a microbiota intestinal em pacientes recorrentes com CDI e CDI grave tendeu a uma comunidade de menor diversidade, mas as diferenças entre esses dois grupos foram menos pronunciadas quando comparados com CDI com pacientes saudáveis. Os autores também concluíram que a recuperação da microbiota intestinal durante o tratamento foi mais dinâmica em pacientes sem recorrência. As mudanças mais profundas na composição da microbiota intestinal e a baixa dinâmica de recuperação de pacientes com ICD recorrente em comparação com indivíduos com infecção única corrobora o fato de que a infecção recorrente é mais difícil de tratar e tem uma taxa de reinfecção mais alta a cada novo episódio. O manejo de CDI recorrente é, portanto, um grande desafio clínico.

Síndrome do intestino irritável

A SII é um dos problemas gastrointestinais mais comuns na prática clínica, com alta morbidade e uma prevalência global em torno de 11% [ 94 ].

O IBS tem sido classicamente associado a mudanças funcionais no eixo cérebro-intestino que envolvem dismotilidade intestinal, disfunção sensório-motora e estresse psicológico. Evidências recentes também endossam a disbiose intestinal como um fator de risco potencial para IBS, causando diretamente a ativação imune intestinal anormal e inflamação intestinal crônica [ 95 ]. A crença de que a disbiose pode ter um papel na patogênese da SII é baseada no fato de que o evento de gastroenterite bacteriana é o preditor mais aceito do desenvolvimento de SII [ 96 ].

FODMAP (oligo-, di- e monossacarídeos fermentáveis ​​e polióis) têm sido amplamente associados com IBS, pois promovem hipersensibilidade visceral, aumentam a motilidade intestinal e promovem desequilíbrio disbiótico pela supressão de bactérias envolvidas no consumo de gás. Apesar dos efeitos benéficos de uma dieta baixa em FODMAP nos sintomas de IBS, ela reduz a concentração luminal de Bifidobacterium e F. prausnitzii [ 97 ]. As consequências a longo prazo de uma dieta baixa em FODMAP permanecem obscuras.

Numerosos estudos evidenciaram uma microbiota intestinal diferente em pacientes com SII, e mesmo os sintomas intestinais foram encontrados positivamente associados a microrganismos específicos. As alterações na microbiota intestinal em pacientes com SII estão representadas na Tabela 3 . Em geral, os pacientes com IBS diminuíram a diversidade microbiana [ 98 ]. Os dados sugeriram um nível aumentado de Firmicutes e uma diminuição de Bacteroidetes [ 99 , 100 ]. Em uma revisão sistemática de 2019 envolvendo 777 pacientes, os autores corroboram essas mudanças na microbiota [ 101 ]. Em contraste, Wang et al. 102 ], apresentou resultados contraditórios.

Tabela 3.

Alterações da microbiota em pacientes com síndrome do intestino irritável

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Bactérias patogênicas potenciais, como Ruminococcus , Clostridium e E. coli , foram relatadas como aumentadas em IBS [ 98 , 100 ]. Embora Lactobacillus e Bifidobacterium tenham sido usados ​​como probióticos, ambos estão aumentados em pacientes com SII em vários ensaios [ 103 ], levantando a questão sobre o papel dessas bactérias na SII.

Em vários estudos de disbiose em IBS, CD e UC, foi confirmado que Faecalibacterium , mais especificamente F. prausnitzii , estava diminuído, tornando este microrganismo um "marcador intestinal saudável". F. prausnitzii tem um forte efeito antiinflamatório in vitro e in vivo, mantendo a saúde intestinal [ 100 , 102 ].

No entanto, os resultados até o momento são inconsistentes, provavelmente devido à influência de fatores de confusão como dieta, caracterização fenotípica dos pacientes e ambientes geográficos.

Modulação terapêutica da microbiota gastrointestinal

Surgiram novas opções terapêuticas, nomeadamente probióticos, prebióticos, simbióticos e transplante de microbiota fecal (FMT) (fig.  1 ). Todos esses visam a restauração da composição da microbiota, homeostase intestinal e defesa da barreira física.

Figura 1.

Visão geral das terapias moduladoras que visam as condições disbióticas e sua relevância atual. NAFLD, doença hepática gordurosa não alcoólica; CDI, infecção por Clostridium difficile ; IBD, doença inflamatória intestinal; IBS, síndrome do intestino irritável; UC, colite ulcerosa; CD, doença de Crohn; FMT, transplante de microbiota fecal.

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Probióticos, prebióticos e simbióticos

Probióticos são microrganismos vivos que conferem benefícios à saúde do hospedeiro quando administrados em quantidades adequadas [ 104 ]. Os probióticos mais comumente usados ​​são Bifidobacterium spp., Lactobacillus spp., Lactococcus spp. E Saccharomyces boulardii . Benefícios probióticos são obtidos aumentando a diversidade da microbiota gastrointestinal e diminuindo microorganismos patogênicos ( Clostridium cluster XI, C. difficile , Clostridium perfringens , Enterococcus faecium e Campylobacter ) [ 105 ], em um cenário de competição bacteriana por nutrição e aderência da mucosa [106 ]. As bifidobactérias , em particular, são capazes de inibir patógenos potenciais, reduzir os níveis de amônia no sangue, produzir vitaminas e enzimas digestivas [ 107 ].

Os probióticos tiveram que superar a descrença ao longo dos anos quanto à falta de evidências para seu uso, devido às dificuldades de reprodutibilidade e padronização de doses e métodos de aplicação. No entanto, evidências recentes sugerem que os probióticos podem ter um papel em um contexto particular de doença, conforme discutido posteriormente.

Os prebióticos são polissacarídeos e oligossacarídeos não digeríveis, como lactulose, frutooligossacarídeos, galacto-oligossacarídeos e inulina, que são fermentados no cólon, resultando em alterações específicas na composição e / ou funções da microbiota gastrointestinal. As fibras prebióticas são encontradas naturalmente em uma dieta comum, principalmente em vegetais como aspargos, alho, alho-poró e cebola [ 108 ]. Os prebióticos apoiam seletivamente o crescimento intestinal de organismos protetores, notavelmente Bifidobacterium e Lactobacilli , e reduzem a permeabilidade intestinal e a endotoxemia metabólica [ 109 ]. O amido resistente é uma forma particular de prebióticos que atrai um interesse crescente em relação aos benefícios sobre a evacuação e inflamação no IBD e CRC [110 ].

Finalmente, os simbióticos são uma combinação de prebióticos e probióticos, com benefícios potenciais para o hospedeiro.

A eficácia dos probióticos, prebióticos ou simbióticos na prática clínica depende da cepa, dosagem e contexto de aplicação. Esses são os aspectos sob investigação que serão discutidos agora.

Câncer colorretal e gástrico

Além dos benefícios imunológicos e metabólicos dos pré e probióticos na saúde intestinal, os efeitos anticarcinogênicos têm sido pesquisados.

Estudos experimentais com probióticos in vitro têm mostrado resultados anticarcinogênicos promissores, pois têm o poder de degradar metabólitos carcinogênicos, aumentar os compostos anticarcinogênicos (SCFA e ácido linoléico conjugado) e inibir a proliferação de células cancerígenas [ 111 ]. Uma preparação simbiótica com inulina enriquecida com oligofrutose, Lactobacillus rhamnosus GC e Bifidobacterium lactis Bb12 reduziu a proliferação colorretal e melhorou a função de barreira epitelial em pacientes polipectomizados [ 112 ]. No entanto, a evidência de benefícios clinicamente importantes ainda é limitada e não há estudos em humanos que mostram uma diminuição do risco de adenomas / CCR.

Os estudos sobre pró e prebióticos em GC têm se concentrado na erradicação do H. pylori . Probióticos usados ​​como adjuvantes do tratamento de H. pylori parecem aumentar as taxas de erradicação, inibindo diretamente o H. pylori e diminuindo os efeitos colaterais da terapia de primeira linha [ 113 ]. Ainda assim, o Consenso de Maastricht V / Florence de 2016 assume evidências muito baixas do efeito benéfico dos probióticos na erradicação do H. pylori [ 114 ], embora eles diminuam significativamente a diarreia associada ao tratamento com antibióticos e possam aumentar a adesão.

Apesar do impacto geral do microbioma no câncer gastrointestinal, pouca atenção tem sido dada aos probióticos como meio de controlar a carcinogênese gástrica e colorretal em humanos.

Doença inflamatória intestinal

Em IBD, resultados discrepantes foram observados entre o poder dos probióticos e prebióticos na DC e UC. Vários estudos comparando probióticos e placebo em pacientes com DC não mostraram evidências claras da utilidade dos probióticos nesta doença [ 115 ]. No entanto, resultados diferentes foram observados na UC, onde a adição de um probiótico ao tratamento convencional melhorou a indução e a remissão de manutenção na colite UC ativa leve a moderada [ 115 ]. E. coli Nissle 1917 demonstrou ser equivalente à mesalazina na manutenção da remissão em pacientes com colite ulcerativa [ 116 ]. Um alimento médico probiótico de alta potência contendo 8 cepas diferentes, chamado VSL # 3®, induz a remissão e alivia a recaída em UC ativa leve a moderada [ 117 ].

Outros probióticos como Bifidobacterium [ 118 ] e Lactobacillus [ 119 ] parecem ter efeitos benéficos no manejo de UC ativa. Além disso, a suplementação com prebióticos como inulina enriquecida com oligofrutose na UC ativa foi associada à redução precoce da calprotectina fecal [ 120 ]. Portanto, nenhuma recomendação clara sobre a dose ou cepas pode ser dada para UC ativa, e mais pesquisas são necessárias.

A bolsa é a complicação mais comum após uma anastomose ileal com bolsa anal na CU. De acordo com a Organização Europeia de Crohn e Colite, há boas evidências da utilidade do VSL # 3® na prevenção de um episódio inicial de bolsite e para manter a remissão da bolsite crônica após o tratamento com antibióticos [ 121 ].

Doença hepática gordurosa não alcoólica

Alguns probióticos têm sido sugeridos como úteis na DHGNA, até mesmo alterando as características do fígado da biópsia, mas nenhum benefício em longo prazo é conhecido [ 122 ]. Um ensaio realizado em crianças obesas com NAFLD confirmada por ultrassonografia demonstrou que aqueles que receberam cápsulas de probióticos ( Lactobacillus acidophilus e ramnose , Bifidobacterium lactis e bifidum ) por 12 semanas tiveram enzimas hepáticas, triglicerídeos e colesterol mais baixos, também com uma melhora no grau de esteatose por ultrassom em comparação com o grupo placebo [ 123 ].

O uso de simbióticos como Bifidobacterium longum com frutooligossacarídeos, quando comparado a modificações no estilo de vida, reduziu significativamente o fator de necrose tumoral-α, proteína C reativa, níveis séricos de aspartato transaminase, resistência à insulina, endotoxina sérica e esteatose documentada por biópsia [ 124 ] .

Uma recente revisão sistemática e meta-análise analisou 25 ensaios clínicos que estudaram a influência de pré, pró e simbióticos em pacientes com NAFLD e apóia o uso potencial de terapias microbianas no tratamento da NAFLD, pois foram encontrados resultados positivos para o índice de massa corporal, enzimas hepáticas, colesterol sérico, colesterol de lipoproteína de baixa densidade e triglicerídeos [ 122 ].

Infecção por C. difficile

À medida que as taxas de CDI aumentam e as estratégias de tratamento convencionais tornam-se menos bem-sucedidas, surgem novas abordagens. Uma revisão recente da Cochrane mostrou que a co-administração de probióticos com antibióticos foi associada a um risco menor de CDI, mas as diretrizes atuais ainda não recomendam o uso rotineiro de probióticos preventivos [ 125 ].

As formulações de prebióticos como meio de tratamento e prevenção de ICD recorrente ainda não têm aplicação clínica comprovada [ 126 ].

Síndrome do intestino irritável

De acordo com a Organização Mundial de Gastroenterologia, algumas cepas probióticas podem reduzir a dor e fornecer alívio global na SII com uma redução consistente do inchaço abdominal e flatulência em estudos publicados [ 127 ]. Uma melhora significativa na dor após a administração de probióticos contendo Bifidobacterium breve , Bifidobacterium longum ou Lactobacillus acidophilus também foi demonstrada por Ortiz-Lucas et al. 128 ]. Curiosamente, os pacientes que tinham uma relação interleucina 10 (IL-10) / IL-12 anormal, indicada como um estado pró-inflamatório, apresentaram níveis normalizados após Bifidobacterium infantis 36624 [ 129 ].

Uma recente meta-análise promovida pelo American College of Gastroenterology estudou 53 RCTs envolvendo 5.545 pacientes com SII. Tomados em conjunto, os probióticos foram estatisticamente superiores ao placebo com um número necessário para tratar de 7, mas com evidência de baixa qualidade para apoiar seu uso [ 130 ]. Com base em uma atualização de 2016 pela British Dietetic Association, não há boas evidências para recomendar um probiótico específico, e eles devem ser usados ​​um de cada vez por no mínimo 4 semanas [ 131 ]. Uma revisão sistemática de 2019 em pacientes com SII não encontrou diferenças entre prebióticos e placebo para sintomas e qualidade de vida [ 132 ].

Transplante de microbiota fecal

A FMT consiste na infusão de fezes de um doador saudável no trato gastrointestinal de um paciente receptor [ 133 ]. Assim, há uma oportunidade de restaurar a complexidade e diversidade da microbiota intestinal, superando os benefícios dos probióticos [ 134 ].

De acordo com várias revisões sistemáticas e meta-análises publicadas recentemente [ 135 - 137 ], a FMT tem sido usada com sucesso no tratamento de CDI recorrente, com uma taxa de cura de aproximadamente 90%. De acordo com as Diretrizes dos EUA publicadas em 2018, a FMT é proposta em pacientes com pelo menos duas recorrências [ 138 ]. As diretrizes do Consenso Europeu [ 133 ] recomendam FMT para ICD recorrente leve e grave e sugerem a consideração de ICD refratária ao tratamento inicial com antibióticos. Ainda não há evidências da FMT como tratamento para o primeiro episódio de CDI. Em um estudo em Portugal, a taxa geral de cura de CDI recorrente ou refratário com FMT foi de 96% (87,5% quando a endoscopia digestiva alta foi usada e 100% com a colonoscopia) [ 139 ].

Em um acompanhamento de curto prazo, a FMT parece ser segura, com os efeitos adversos relatados mais comuns sendo desconforto abdominal, diarreia, constipação e febre baixa. Os efeitos colaterais graves parecem ser incomuns e incluem recidiva da DII, transmissão de patógenos entéricos, pneumonia, infecção / sepse e SII pós-infecciosa. Os efeitos potenciais de longo prazo estão relacionados à possibilidade de transmissão de infecções não reconhecidas que podem causar doença anos mais tarde e induzir doenças crônicas, conforme relatado em relatos de casos, como obesidade, diabetes, NAFLD, asma, autismo e outros [ 140 , 141Para garantir as condições de segurança, há um processo de seleção de doadores, que inclui entrevista médica, exames de sangue e fezes. O Consenso Europeu propôs acompanhamento clínico e analítico pelo menos por 8 semanas após a FMT [ 133 ].

Atualmente, devido às taxas de sucesso da FMT em CDI recorrente, há um grande interesse em avaliar a FMT para doenças implicadas na microbiota intestinal alterada, em particular IBD, IBS e constipação idiopática. Um achado interessante foi que o FMT foi menos eficaz em pacientes recorrentes com ICD com DII em comparação com pacientes sem DII. Na verdade, 25% dos pacientes com DII tiveram um surto após FMT [ 142 ].

Como os pré e probióticos na DII, a DC tem menos probabilidade de responder à FMT do que a UC. No entanto, um estudo piloto [ 143 ] demonstrou altas taxas de melhora clínica e remissão em pacientes com DC refratária após FMT. Ainda não há ensaios clínicos randomizados de FMT em DC. Pacientes UC ativos sob terapia FMT alcançaram remissão em uma proporção significativamente maior em comparação com o grupo de placebo. Aqueles em UC em estágio inicial alcançaram taxas de sucesso mais altas do que aqueles em UC em estágio avançado. Curiosamente, a maioria dos pacientes que atingiram a remissão recebeu fezes de um doador saudável [ 144 ]. Portanto, o FMT é uma alternativa promissora para o IBD, exigindo uma investigação mais aprofundada para apoiar a recomendação.

Espera-se que o IBS se beneficie do potencial do FMT. Um ensaio clínico randomizado de 2018 analisou 83 pacientes com SII, 55 dos quais receberam FMT. Sessenta e cinco por cento dos pacientes no grupo FMT e 43% no grupo placebo diminuíram os escores de gravidade da SII 3 meses após o tratamento [ 145 ]. Ainda assim, resultados conflitantes não suportam atualmente um uso generalizado deste tratamento [ 146 ].

O FMT pode teoricamente ser útil na NAFLD e no câncer gastrointestinal, uma vez que a microbiota desempenha um papel na sua patogênese. No entanto, seus benefícios potenciais nessas condições ainda não foram estudados.

A descrição da disbiose em muitos distúrbios não gastrointestinais aumentou a investigação sobre a indicação potencial de FMT para aqueles. Atualmente, os estudos de FMT estão se expandindo para autismo, esclerose múltipla, doenças metabólicas, púrpura trombocitopênica idiopática, doenças autoimunes, distúrbios alérgicos e outros distúrbios psiquiátricos [ 141 ]. Uma investigação adicional da FMT deve se concentrar na descrição da dosagem e do momento da FMT, além dos dados demográficos e clínicos do paciente.

Conclusão

O recente crescimento do sequenciamento genômico do microbioma está revelando inúmeras correlações entre desequilíbrios disbióticos e doenças gastrointestinais. No entanto, estes representam os estágios iniciais da pesquisa, onde poucas relações causais foram estabelecidas. Estudos em modelos de camundongos afirmaram que a disbiose desempenha um papel na patogênese da carcinogênese induzida por inflamação e pode acontecer antes do início das doenças.

A maioria das Proteobactérias é considerada desvantajosa, como comprovado por seu aumento em IBD e CDI, em contraste com Firmicutes que estão diminuídos em pacientes com IBD, CRC, NAFLD e CDI. Mesmo em pacientes saudáveis, fatores como dieta, IBP ou antibióticos modulam a microbiota intestinal. A terapia de longo prazo com antibióticos de amplo espectro, dieta ocidental e a inibição da acidez gástrica por IBP são fatores de risco bem estabelecidos para doenças associadas à disbiose. No entanto, até à data não existe consenso sobre o que constitui uma microbiota normal e, na prática clínica, é difícil integrar os resultados da análise da microbiota de pacientes individuais, nomeadamente para escolher a melhor forma de restaurar a microbiota normal.

Evidências crescentes apóiam os probióticos como terapia adjuvante, principalmente em NAFLD, CDI, UC e IBS. Os autores acreditam que mais ensaios clínicos de pré e probióticos usando cepas padronizadas, doses e duração do tratamento são indispensáveis ​​para colocar essas formulações nas diretrizes internacionais. Por outro lado, FMT é uma opção estabelecida para CDI recorrente. No entanto, a aplicação de FMT em outras doenças associadas à disbiose carece de ensaios clínicos randomizados para apoiar a recomendação.

Declaração de Divulgação

Os autores declaram não haver conflito de interesses.



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Contatos do autor

Dra. Raquel Ortigão

Serviço de Gastrenterologia, Instituto Português de Oncologia do Porto

Rua Dr. António Bernardino de Almeida

PT – 4200-072 Porto (Portugal)

E-mail raquel.ortigao@hotmail.com

Fonte:https://www.karger.com/Article/Fulltext/505036



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